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樣品采集
選擇采集部位:通常從疑似感染松材線蟲病的松樹樹干、樹枝、樹皮等部位采集樣品。樹干可選取靠近基部或病變明顯區(qū)域;樹枝選取枯萎、變色部分;樹皮則選取有松脂滲出、變色或有蟲道痕跡的部位。
采集工具準(zhǔn)備:準(zhǔn)備好鋒利的刀具、鋸子、鑷子、密封袋或離心管等工具。刀具和鋸子要確保清潔,避免交叉污染。
采集操作:用刀具或鋸子截取適量木材樣本,一般長度為 5 - 10 厘米,直徑 1 - 2 厘米。若采集樹皮,可取 5 - 10 平方厘米大小。將采集的樣品放入密封袋或離心管中,標(biāo)注好采集地點(diǎn)、時間、樹木編號等信息。
樣品粉碎
粉碎設(shè)備選擇:可使用組織研磨儀、粉碎機(jī)等設(shè)備。組織研磨儀能更均勻地粉碎樣品,但價格相對較高;粉碎機(jī)操作簡單,成本較低。
粉碎操作:將采集的樣品放入粉碎設(shè)備中,加入適量的液氮(若設(shè)備允許),液氮可使樣品迅速冷凍變脆,便于粉碎。啟動粉碎設(shè)備,將樣品粉碎成細(xì)小的顆粒狀,一般粉碎至粉末狀,粒度在 0.1 - 1 毫米左右。
核酸提取
提取試劑準(zhǔn)備:根據(jù)所選的核酸提取試劑盒說明書,準(zhǔn)備好相應(yīng)的試劑,如裂解液、洗滌液、洗脫液等。
提取步驟:將粉碎后的樣品轉(zhuǎn)移至離心管中,加入適量的裂解液,充分混勻,使樣品中的細(xì)胞破裂,釋放出核酸。然后進(jìn)行離心操作,去除雜質(zhì)和細(xì)胞碎片。接著加入洗滌液,多次洗滌沉淀,去除殘留的雜質(zhì)。最后加入洗脫液,將核酸洗脫下來,收集到干凈的離心管中。
核酸純化(可選)
純化目的:若提取的核酸中含有較多的雜質(zhì),如蛋白質(zhì)、多糖等,可能會影響后續(xù)的檢測結(jié)果,此時需要進(jìn)行核酸純化。
純化方法:可使用柱式純化法或磁珠純化法。柱式純化法是將核酸溶液加入到純化柱中,通過離心等方式使核酸吸附在柱子上,去除雜質(zhì)后再洗脫下來;磁珠純化法是利用磁珠與核酸的特異性結(jié)合,將核酸從溶液中分離出來。
樣品保存與運(yùn)輸
保存條件:處理好的核酸樣品若不能立即進(jìn)行檢測,應(yīng)將其保存在 -20℃或 -80℃的冰箱中,防止核酸降解。
運(yùn)輸要求:在運(yùn)輸過程中,要使用干冰或冰袋保持低溫環(huán)境,確保樣品的質(zhì)量不受影響。同時,要做好樣品的防護(hù),避免樣品泄漏或損壞。
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